Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox17P56394 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox17P56394 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cox17P56394 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cox17P56394 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms