Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pex2P55098 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pex2P55098 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pex2P55098 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pex2P55098 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex2P55098 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex2P55098 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pex2P55098 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex2P55098 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex2P55098 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pex2P55098 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pex2P55098 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pex2P55098 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex2P55098 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex2P55098 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pex2P55098 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex2P55098 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms