Protein–RNA interactions for Protein: P55012

Slc12a2, Solute carrier family 12 member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a2P55012 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a2P55012 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a2P55012 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a2P55012 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc12a2P55012 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a2P55012 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms