Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn5P54830 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn5P54830 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn5P54830 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn5P54830 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn5P54830 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms