Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolgP54099 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PolgP54099 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolgP54099 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolgP54099 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolgP54099 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolgP54099 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PolgP54099 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PolgP54099 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PolgP54099 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolgP54099 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolgP54099 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolgP54099 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolgP54099 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PolgP54099 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolgP54099 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolgP54099 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PolgP54099 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolgP54099 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolgP54099 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolgP54099 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolgP54099 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolgP54099 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolgP54099 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolgP54099 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolgP54099 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolgP54099 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolgP54099 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolgP54099 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PolgP54099 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolgP54099 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolgP54099 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolgP54099 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolgP54099 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolgP54099 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolgP54099 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolgP54099 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolgP54099 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolgP54099 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolgP54099 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolgP54099 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolgP54099 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolgP54099 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolgP54099 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolgP54099 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolgP54099 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolgP54099 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolgP54099 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolgP54099 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolgP54099 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolgP54099 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolgP54099 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PolgP54099 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolgP54099 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolgP54099 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolgP54099 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolgP54099 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PolgP54099 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolgP54099 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolgP54099 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolgP54099 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolgP54099 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolgP54099 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PolgP54099 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolgP54099 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolgP54099 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolgP54099 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolgP54099 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PolgP54099 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms