Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Fgd1P52734 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Fgd1P52734 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Fgd1P52734 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Fgd1P52734 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fgd1P52734 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,8 ms