Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa10P50708 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa10P50708 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa10P50708 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa10P50708 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa10P50708 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms