Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FmodP50608 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FmodP50608 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FmodP50608 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FmodP50608 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FmodP50608 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FmodP50608 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FmodP50608 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FmodP50608 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FmodP50608 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FmodP50608 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FmodP50608 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FmodP50608 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FmodP50608 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FmodP50608 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FmodP50608 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FmodP50608 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FmodP50608 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FmodP50608 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FmodP50608 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FmodP50608 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FmodP50608 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FmodP50608 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FmodP50608 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FmodP50608 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FmodP50608 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FmodP50608 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FmodP50608 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FmodP50608 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FmodP50608 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FmodP50608 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FmodP50608 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FmodP50608 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FmodP50608 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FmodP50608 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FmodP50608 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms