Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TubP50586 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TubP50586 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TubP50586 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TubP50586 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TubP50586 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TubP50586 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TubP50586 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TubP50586 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TubP50586 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TubP50586 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TubP50586 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TubP50586 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TubP50586 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TubP50586 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TubP50586 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TubP50586 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TubP50586 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TubP50586 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TubP50586 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TubP50586 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TubP50586 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TubP50586 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TubP50586 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TubP50586 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TubP50586 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TubP50586 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TubP50586 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TubP50586 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TubP50586 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TubP50586 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TubP50586 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TubP50586 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TubP50586 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TubP50586 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TubP50586 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TubP50586 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TubP50586 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TubP50586 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TubP50586 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TubP50586 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TubP50586 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TubP50586 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TubP50586 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TubP50586 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TubP50586 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TubP50586 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TubP50586 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TubP50586 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TubP50586 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TubP50586 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TubP50586 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TubP50586 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TubP50586 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms