Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nkx2-1P50220 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-1P50220 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkx2-1P50220 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms