Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BckdhaP50136 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdhaP50136 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BckdhaP50136 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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