Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdkn1cP49919 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdkn1cP49919 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdkn1cP49919 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms