Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfx2P48379 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfx2P48379 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rfx2P48379 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfx2P48379 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rfx2P48379 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms