Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf4P43488 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf4P43488 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf4P43488 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms