Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msh2P43247 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msh2P43247 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh2P43247 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msh2P43247 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh2P43247 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh2P43247 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh2P43247 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh2P43247 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msh2P43247 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msh2P43247 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msh2P43247 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms