Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp9P41245 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mmp9P41245 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mmp9P41245 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mmp9P41245 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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