Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl28P41105 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl28P41105 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl28P41105 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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