Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FynP39688 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FynP39688 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FynP39688 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FynP39688 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FynP39688 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FynP39688 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FynP39688 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FynP39688 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FynP39688 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FynP39688 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FynP39688 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FynP39688 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FynP39688 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FynP39688 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FynP39688 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FynP39688 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FynP39688 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FynP39688 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FynP39688 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FynP39688 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FynP39688 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FynP39688 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FynP39688 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FynP39688 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FynP39688 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FynP39688 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FynP39688 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FynP39688 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FynP39688 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FynP39688 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FynP39688 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FynP39688 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FynP39688 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FynP39688 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FynP39688 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FynP39688 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FynP39688 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FynP39688 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FynP39688 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FynP39688 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FynP39688 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FynP39688 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FynP39688 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FynP39688 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms