Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf2P39429 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf2P39429 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf2P39429 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf2P39429 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf2P39429 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Traf2P39429 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf2P39429 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf2P39429 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf2P39429 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf2P39429 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf2P39429 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf2P39429 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf2P39429 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf2P39429 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms