Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lig1P37913 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig1P37913 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig1P37913 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lig1P37913 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lig1P37913 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lig1P37913 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lig1P37913 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig1P37913 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lig1P37913 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lig1P37913 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lig1P37913 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig1P37913 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig1P37913 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms