Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rfc1P35601 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rfc1P35601 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rfc1P35601 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rfc1P35601 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms