Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptger1P35375 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptger1P35375 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptger1P35375 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptger1P35375 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptger1P35375 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms