Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab17P35292 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab17P35292 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rab17P35292 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab17P35292 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab17P35292 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab17P35292 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab17P35292 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab17P35292 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab17P35292 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab17P35292 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab17P35292 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab17P35292 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab17P35292 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab17P35292 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab17P35292 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab17P35292 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab17P35292 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab17P35292 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms