Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Saa4P31532 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Saa4P31532 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Saa4P31532 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Saa4P31532 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Saa4P31532 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Saa4P31532 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Saa4P31532 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Saa4P31532 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Saa4P31532 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Saa4P31532 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms