Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DesP31001 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DesP31001 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DesP31001 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DesP31001 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DesP31001 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DesP31001 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DesP31001 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DesP31001 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DesP31001 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DesP31001 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DesP31001 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DesP31001 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DesP31001 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DesP31001 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DesP31001 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DesP31001 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DesP31001 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DesP31001 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DesP31001 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DesP31001 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DesP31001 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DesP31001 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DesP31001 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DesP31001 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DesP31001 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DesP31001 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DesP31001 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DesP31001 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DesP31001 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DesP31001 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DesP31001 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DesP31001 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DesP31001 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DesP31001 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DesP31001 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DesP31001 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DesP31001 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DesP31001 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DesP31001 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DesP31001 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DesP31001 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DesP31001 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DesP31001 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DesP31001 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DesP31001 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DesP31001 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DesP31001 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DesP31001 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DesP31001 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DesP31001 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DesP31001 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DesP31001 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DesP31001 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DesP31001 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DesP31001 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DesP31001 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DesP31001 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DesP31001 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DesP31001 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DesP31001 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DesP31001 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DesP31001 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms