Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fkbp4P30416 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fkbp4P30416 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fkbp4P30416 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fkbp4P30416 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fkbp4P30416 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fkbp4P30416 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms