Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TbpP29037 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TbpP29037 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TbpP29037 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TbpP29037 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TbpP29037 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TbpP29037 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TbpP29037 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TbpP29037 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TbpP29037 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TbpP29037 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TbpP29037 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TbpP29037 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TbpP29037 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TbpP29037 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TbpP29037 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TbpP29037 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TbpP29037 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TbpP29037 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TbpP29037 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TbpP29037 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TbpP29037 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TbpP29037 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TbpP29037 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TbpP29037 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TbpP29037 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TbpP29037 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TbpP29037 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TbpP29037 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TbpP29037 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TbpP29037 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TbpP29037 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TbpP29037 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TbpP29037 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TbpP29037 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TbpP29037 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TbpP29037 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TbpP29037 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TbpP29037 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TbpP29037 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TbpP29037 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TbpP29037 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TbpP29037 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TbpP29037 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TbpP29037 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TbpP29037 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TbpP29037 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TbpP29037 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms