Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Etv4P28322 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv4P28322 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Etv4P28322 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Etv4P28322 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv4P28322 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv4P28322 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv4P28322 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Etv4P28322 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Etv4P28322 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Etv4P28322 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Etv4P28322 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms