Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gjb3P28231 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb3P28231 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb3P28231 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gjb3P28231 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb3P28231 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms