Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gjb1P28230 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjb1P28230 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjb1P28230 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gjb1P28230 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjb1P28230 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms