Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lef1P27782 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lef1P27782 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lef1P27782 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lef1P27782 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lef1P27782 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lef1P27782 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lef1P27782 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lef1P27782 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms