Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl3P27659 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl3P27659 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl3P27659 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3P27659 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3P27659 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl3P27659 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl3P27659 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl3P27659 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3P27659 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3P27659 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3P27659 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl3P27659 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl3P27659 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3P27659 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3P27659 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3P27659 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl3P27659 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl3P27659 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl3P27659 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl3P27659 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl3P27659 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms