Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfraP26618 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfraP26618 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfraP26618 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 444.2 ms