Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccnd1P25322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd1P25322 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnd1P25322 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms