Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh1a1P24549 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aldh1a1P24549 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a1P24549 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a1P24549 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms