Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd247P24161 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd247P24161 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd247P24161 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd247P24161 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd247P24161 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd247P24161 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd247P24161 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd247P24161 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd247P24161 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd247P24161 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd247P24161 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms