Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ggta1P23336 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ggta1P23336 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ggta1P23336 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Ggta1P23336 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Ggta1P23336 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ggta1P23336 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ggta1P23336 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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