Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PparaP23204 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PparaP23204 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PparaP23204 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PparaP23204 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PparaP23204 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PparaP23204 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PparaP23204 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PparaP23204 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PparaP23204 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PparaP23204 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PparaP23204 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PparaP23204 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PparaP23204 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PparaP23204 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PparaP23204 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PparaP23204 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PparaP23204 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PparaP23204 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PparaP23204 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PparaP23204 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PparaP23204 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PparaP23204 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PparaP23204 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PparaP23204 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PparaP23204 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PparaP23204 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PparaP23204 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PparaP23204 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PparaP23204 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PparaP23204 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PparaP23204 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PparaP23204 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PparaP23204 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PparaP23204 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PparaP23204 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PparaP23204 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PparaP23204 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PparaP23204 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PparaP23204 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PparaP23204 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PparaP23204 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PparaP23204 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PparaP23204 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PparaP23204 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PparaP23204 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PparaP23204 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PparaP23204 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PparaP23204 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PparaP23204 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PparaP23204 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PparaP23204 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PparaP23204 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PparaP23204 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PparaP23204 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PparaP23204 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PparaP23204 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PparaP23204 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PparaP23204 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PparaP23204 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PparaP23204 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PparaP23204 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms