Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myd88P22366 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Myd88P22366 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myd88P22366 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myd88P22366 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Myd88P22366 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myd88P22366 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myd88P22366 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myd88P22366 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Myd88P22366 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Myd88P22366 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myd88P22366 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms