Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tap1P21958 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tap1P21958 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tap1P21958 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tap1P21958 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tap1P21958 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tap1P21958 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tap1P21958 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tap1P21958 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tap1P21958 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tap1P21958 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tap1P21958 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tap1P21958 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tap1P21958 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tap1P21958 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tap1P21958 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tap1P21958 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms