Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csn1s1P19228 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csn1s1P19228 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csn1s1P19228 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csn1s1P19228 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms