Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RargP18911 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RargP18911 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RargP18911 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RargP18911 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RargP18911 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RargP18911 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RargP18911 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RargP18911 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RargP18911 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RargP18911 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RargP18911 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RargP18911 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RargP18911 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RargP18911 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RargP18911 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RargP18911 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RargP18911 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RargP18911 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RargP18911 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RargP18911 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RargP18911 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RargP18911 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RargP18911 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RargP18911 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RargP18911 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RargP18911 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RargP18911 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RargP18911 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RargP18911 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RargP18911 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RargP18911 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RargP18911 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RargP18911 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RargP18911 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RargP18911 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RargP18911 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RargP18911 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RargP18911 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RargP18911 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RargP18911 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RargP18911 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RargP18911 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RargP18911 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RargP18911 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RargP18911 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RargP18911 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RargP18911 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RargP18911 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RargP18911 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RargP18911 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RargP18911 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RargP18911 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RargP18911 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RargP18911 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RargP18911 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RargP18911 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RargP18911 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RargP18911 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RargP18911 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms