Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Spi1P17433 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spi1P17433 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spi1P17433 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Spi1P17433 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spi1P17433 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spi1P17433 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spi1P17433 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spi1P17433 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms