Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rb1P13405 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rb1P13405 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1P13405 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rb1P13405 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1P13405 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rb1P13405 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.4 ms