Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vpreb2P13373 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms