Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbk3P0C5K0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sbk3P0C5K0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbk3P0C5K0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbk3P0C5K0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms