Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NefmP08553 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NefmP08553 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NefmP08553 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NefmP08553 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NefmP08553 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NefmP08553 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NefmP08553 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NefmP08553 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NefmP08553 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NefmP08553 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NefmP08553 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NefmP08553 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NefmP08553 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NefmP08553 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NefmP08553 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NefmP08553 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NefmP08553 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NefmP08553 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NefmP08553 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NefmP08553 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NefmP08553 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NefmP08553 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NefmP08553 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NefmP08553 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NefmP08553 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NefmP08553 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NefmP08553 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NefmP08553 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NefmP08553 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NefmP08553 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NefmP08553 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NefmP08553 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NefmP08553 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NefmP08553 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NefmP08553 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NefmP08553 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NefmP08553 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NefmP08553 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NefmP08553 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NefmP08553 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NefmP08553 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NefmP08553 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NefmP08553 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NefmP08553 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NefmP08553 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NefmP08553 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NefmP08553 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NefmP08553 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NefmP08553 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NefmP08553 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NefmP08553 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NefmP08553 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NefmP08553 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NefmP08553 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NefmP08553 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NefmP08553 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NefmP08553 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NefmP08553 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NefmP08553 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NefmP08553 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NefmP08553 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NefmP08553 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NefmP08553 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NefmP08553 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NefmP08553 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NefmP08553 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NefmP08553 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NefmP08553 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NefmP08553 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NefmP08553 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms