Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Egr1P08046 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Egr1P08046 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egr1P08046 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Egr1P08046 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Egr1P08046 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Egr1P08046 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Egr1P08046 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Egr1P08046 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Egr1P08046 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Egr1P08046 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms