Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Eb1P04230 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2-Eb1P04230 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Eb1P04230 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Eb1P04230 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms