Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tk1P04184 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tk1P04184 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tk1P04184 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tk1P04184 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tk1P04184 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tk1P04184 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tk1P04184 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tk1P04184 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tk1P04184 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tk1P04184 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tk1P04184 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms